问答:混合动态模型在COVID-19规划和超越

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的网络研讨会混合动态模型在COVID-19规划吸引了创纪录数量的参与者,并促使一些重大问题的主题仿真建模和医疗保健计划。

我们有机会举办研讨会和纳撒尼尔·奥斯古德博士,计算机科学系教授和助理教师的社区卫生和流行病学的萨斯喀彻温省大学。由于有这么多的参加者和这样一个相关的话题,鉴于目前的形势,我们经历了很多互动和伟大的问题问我们的网络研讨会的专家!下面,你会发现网络研讨会的细节,记录,纳撒尼尔·奥斯古德博士的问答答案。

混合动态模型在COVID-19规划

而动态建模的各种传统太了解每个授予政策分析师和决策者在公共卫生和医疗保健,每个由一组有限的潜在特性的限制。更广泛地说,一旦建立,从每个动态模型建模的传统历来遭受快速退化,越来越脱离世界上新的证据和展开过程视为随机进化模型中。

等机器学习工具,包括算法辅助粒子滤波和粒子密度——许多元素上面的学习过程可以自动化,将新传入的证据在频繁进行的基础上,并使用它来完善对潜在的系统状态的理解,估计的参数驱动系统中扮演着重要的角色,并评估政策的权衡。在这个谈话中,我们将讨论如何类混合模型可以帮助更多的洞察力的,透明的,和敏捷建模的背景下展开的不确定性,与COVID-19爆发作为中央范例。



回答医生的问题,被要求Nathanial奥斯古德在网络研讨会


你认为需要游客的影响将是流感疫苗在老年护理访问吗?

这是一个非常有趣的问题,可能的风险非常重要的第二或第三波即将到来的流感季节期间,包括区分可能从covid流感。


你的计算,这可能是最好的估计COVID19“罗”的生育数量在你的意见吗?

这个变化尤其是上下文甚至在我们省——例如,在拥挤的住房在我省北部地区,相对于农村或城市地区。


你的方法验证、校准和灵敏度分析在混合模型有何不同?

我们可以使用来自不同尺度的数据通常承担这样的任务。它有时也可以帮助从事“部分模型校准”通过交换模块和回来。


如何将您的模型用不同的形式在一起,这样它们喂彼此吗?

这在AnyLogic相当简单。请看到我的很多视频的机制在AnyLogic构建不同类型的混合模型。


在拉丁美洲国家及其处理covid-19,你认为还有其他的变量应该被添加到模型?如果是这样,他们是什么?

正确回答这个问题,我需要了解更多关于拉丁美洲上下文,包括公共交通、住宅混合,拥挤和差异,室内与室外工作环境。


未报告的病例数为政策制定者和保健提供者是一个关键的挑战。什么见解你表面模型在这方面吗?能后掷鱼线未报告的病例的一部分吗?

是的,它可以后掷鱼线未报告的病例数,有效的繁殖数量,估计的求医行为,等等。


是什么粒子模型的性能在没有确诊病例是可用的吗?

这种情况下作为一个非常重要的和粒子滤波模型的成功应用,因为它往往会重新研磨的模型,杂草/ downweights粒子假定爆发在这段时间里,和维护的敏感,直到和疫情发生。


你能更详细地解释模型的方式占社会距离和政府的全职订单吗?

这是复杂的,因为它广泛影响工作场所,学校,家庭和社区混合。社会距离影响的平衡时间,他们花在社区。工作在不久的将来将代表社区环境与更大的粒度。


所有的病人在DES在医院或社区的途径去吗?

DES组件可以包括社区的一些组件。代理保持个性化当离开通路。


PF模型可以包含数据来自不同国家/省学习和/或比较它们?

PF模型已成功应用于各种各样的分布。契约式的公共卫生机构,我们正在申请在加拿大省份,并收到请求申请其他国家。


在你的模型中,严重病例变成临界情况下吗?如果是这样,它如何影响模型?

的模型显示,“严重”包括关键的情况下的一个子集(世卫组织)定义的。反弹道导弹,关键的情况下明确的考虑。


经济方面(医院资金等)也被认为是在模型中,提出了今天好吗?

目前,不考虑直接成本,尽管资源使用作为一个粗略的代理。我们计划增加成本。


粒子滤波在AnyLogic完成吗?

是的,粒子滤波AnyLogic内进行。而我们的方法有先进的多,基本的概述的方法例子AnyLogic仿真模型与粒子滤波。(视频)


CI的粒子的结果是什么?

作为一个贝叶斯方法,这里可信度区间CI。粒子滤波估计(通过抽样)联合分布模型;我们容易计算可信度的间隔。


如何整体误差计算通过异构模型数据的来源吗?

粒子滤波使用一个整体似然函数,一个关键的角色在更新后随着每一个新的向量之前观察。似然函数考虑了不同类型的观察。


基于混合剂,系统动力学模型,什么规模的人口可以提供给你一个非常大的比例将会最终成为一个代理商吗?也有办法捕捉年龄相关传输之前创建的代理吗?

是的,总传输模型的年龄分层,为慢性疾病的过程中进一步分层。基于我们组的其他模型,我们期望能够处理成千上万的代理。


如果我有兴趣一起工作,进入接触的第一步是什么?

我们愿意探索协作。几个我们的模型被接受和适应了其他地方。知道哪个模型(s)被认为是有用的建议。请写christine.hillis@usask。ca如果你想建立一个会议来探讨这个问题。


是模型和/或文档公开审查?

公开发布预期但需要终止与我们的医疗系统合作伙伴。如果你愿意,请写信通知。


我们可以邮件与主持人的主页,以及任何文件(工作或发表),他写了吗?

纳撒尼尔·奥斯古德学院主页。许多论文可以找到这个超越蒙上眼睛模型页面]


有没有可能科研合作如果我们想应用模型在澳大利亚卫生部门吗?

我们愿意探索协作。几个我们的模型被接受和适应了其他地方。知道哪个模型(s)被认为是有用的建议。请写christine.hillis@usask。ca如果你想建立一个会议来探讨这个问题。


模型可供下载的例子吗?

公开发布预期但需要终止与我们的医疗系统合作伙伴。如果你愿意,请写信通知。


是你的训练营(8/24 ~ 8/29)举行今年在人或在线吗?

谢谢你的问题,由于COVID-19爆发,我们不能把人今年夏天的训练营。我们正在考虑举行一个在线版本,但是需要认真的表达兴趣。请写christine.hillis@usask。如果你有兴趣。


我们可以运行您的SD / ABM / DES在加拿大其他省份吗?例如,裴

我们愿意探索协作。几个我们的模型被接受和适应了其他地方。知道哪个模型(s)被认为是有用的建议。请写christine.hillis@usask。ca如果你想建立一个会议来探讨这个问题。

纳撒尼尔·d·奥斯古德博士

纳撒尼尔·奥斯古德博士
纳撒尼尔·奥斯古德博士

纳撒尼尔·d·奥斯古德博士是一位计算机科学教授和助理教师的社区卫生和流行病学的萨斯喀彻温省大学。他的研究重点是提供交联模拟,无处不在的传感和机器学习工具通知理解人口健康趋势和卫生政策的权衡。他的应用程序的工作解决挑战的传染性,人畜共患,环境和慢性疾病领域。奥斯古德博士进一步两小说的共同创造者移动传感器的流行病学监测系统,最近谷歌Android和苹果iEpi移动流行病学监测系统(现在出版的健康)。他有另外贡献创新改善动态建模质量和效率,引入新颖的技术组合多个仿真方法和仿真模型与决策分析工具,并利用这样的模型使用收集的数据从无线流行病学监测系统。奥斯古德博士已经导致许多国际课程仿真建模和世界各地的卫生,和他的在线视频的每月吸引成千上万的观点。加入U S教师之前,他毕业于麻省理工学院计算机科学博士学位,1999年在麻省理工学院担任高级讲师和工作了许多年的各种学术、咨询和行业地位。


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